Naviger i denne bloggen

Veien gjennom jungelen

tirsdag 23. oktober 2018

PICO, Problemstilling og søkekomponenter

PICO

Populasjon/pasient, intervensjon/eksponering, sammenligning og utfall.
  • I populasjon spør vi ofte etter mennesker og hva som kjennetegner disse menneskene. Har de f.eks. en spesiell alder? En spesiell nasjonalitet? En sykdom? Eller har de andre kjennetegn?
  • I intervensjon spør vi om hvilke(t) tiltak vi ønsker å utsette populasjonen for. Er det f.eks. en ny type behandling? Et lovpåbud? Et spesielt forebyggingstiltak?
  • I sammenligning spør vi om intervensjonen skal sammenlignes med noe. Er det f.eks. en annen behandling? Eller er fravær av intervensjon?
  • I utfall spør vi etter hva vi tror kan skje ved innføring av tiltaket. Er det f.eks. at man lever lengre? Blir fortere friskere? Unngår å få en sykdom?

PICO-skjemaet er designet for å bryte effektspørsmål ned i bolker. Når vi har andre typer forskningsspørsmål, kan vi få problemer med å plotte elementene inn i skjemaet. Det er utviklet en rekke andre skjemaer for andre typer spørsmål. Men dersom du har lykkes med å analysere spørsmålet i så stor utstrekning, at du er i stand til å identifisere hvilket skjema som kan passe, vil jeg våge å påstå at du har så god oversikt over problemstillingen at du er klar for å starte på søket. Husk at PICO ikke er målet, men et hjelpemiddel på veien mot et søk.


Fra PICO til søk I - et eksempel fra læreboka

I effektspørsmål er det som oftest populasjonen og intervensjonen vi bruker i litteratursøket. Vi søker sjelden på utfall av to grunner: For det første kan det være lurt å åpne opp for utfall vi ikke har tenkt på og for det andre kan utfallene ofte være litt uhåndgripelige, "ullne" og søketeknisk utfordrende å søke på. Utfallet "raskere bedring" (se under) er et godt eksempel på det siste. Når vi har identifisert søkekomponentene, kan vi begynne å samle søkeord til hver komponent.

PICO: bør man behandle voksne med akutt bronkitt med antibiotika?

Populasjon: Voksne med akutt bronkitt
Intervensjon: Antibiotika
Sammenligning: Ingen behandling
Utfall: Raskere bedring

Her får vi to søkekomponenter: Bronkitt og Antibiotika. De to søkekomponentene kobles sammen med operatoren AND.

For hver søkekomponent leter vi frem kontrollerte emneord og søkeord til fritekstsøk. Disse ordene kobler vi sammen med operatoren OR.

I noen tilfeller kan en bolk i PICO-skjemaet utgjøre to søkekomponenter. Det ville vært tilfelle her dersom vi for eksempel var interessert i barn med akutt bronkitt. Men voksne er ikke en gruppe vi søker på, fordi denne gruppen ("normalen") ikke nødvendigvis blir spesifisert i litteraturen.

Ferdig søkestrategi


1
exp Bronchitis/
28876
2
(Bronchitis or Bronchitides or Bronchiolitis or Bronchiolitides or "Cryptogenic Organizing Pneumonia*" or BOOP).tw,kf.
31781
3
1 or 2
42988
4
Anti-Bacterial Agents/
304215
5
("Antibacterial Agent*" or "Anti bacterial Agent*" or "Antibacterial Compound*" or "Anti bacterial Compound*" or "Bacteriocidal Agent*" or Bacteriocides or "Antimycobacterial Agent*" or "Anti Mycobacterial Agent*" or Antibiotic*).tw,kf.
317658
6
4 or 5
477069
7
3 and 6
4035
* Linje 5 kan effektiviseres til ((Antibacterial or "Anti bacterial") adj (Agent* or Compound*) or ((Bacteriocidal or Antimycobacterial or "Anti Mycobacterial") adj Agent*) or Bacteriocides or Antibiotic*)

 

Fra PICO til søk II - et eksempel fra bakvendtland

Oppdragsgiver hadde to problemstillinger om smitte av hepatitt C gjennom seksuell kontant, og leverte følgende PICO-skjemaer

PICO 1: Risiko for smitte av hepatitt C gjennom seksuell blodkontakt mellom menn som har sex med menn

Populasjon: Menn som har sex med menn
Eksponering: Seksuell eksponering med blod kontakt, f.eks. analsex, finger-anal kontakt
Utfall: Påvist smitte av hepatitt C

PICO 2: I hvilken grad smitter hepatitt C seksuelt gjennom samleie?

Populasjon: Personer som ikke er smittet med hepatitt C og som har samleie med hepatitt C smittede, særlig diskordante par
Eksponering: Ubeskyttet samleie (vaginalt og analt)
Utfall: Påvist hepatitt C smitte

Dette er ikke effektspørsmål, men oppdragsgiver fikk likevel problemstillingene plottet inn i PICO-skjemaer. I dette søkeoppdraget finner vi Hepatitt C, som der hovedtemaet for søket, i utfallet. Dermed blir dette et av tilfellene vi må bruke utfall i søket. Hepatitt C blir den første søkekomponenten.

Videre er oppdragsgiver interessert i å se på smitte gjennom seksuell kontakt. Her kan vi se for oss 3 søkekomponenter som vi må koble sammen på et ny måte: ((Seksuelt overførbare sykdommer OR (Sex AND Smitte)). Eksponeringen er litt forskjellig på de to søkene, men en mange av søkeord vil være aktuelle for begge søk.

Populasjonen i PICO 1 er menn som har sex med menn, noe som er helt problemfritt å søke på, men populasjonen i PICO 2 er heterofile par. Her gjelder det samme som i lærebokeksemplet over: det vanligste blir ikke nødvendigvis spesifisert i litteraturen. Vi kan derfor ikke bruke det i søket.

Søkekomponentene i PICO 1: Hepatitt C AND ((Seksuelt overførbare sykdommer OR (Sex AND Smitte)) AND Menn som har sex med menn

Søkekomponentene i PICO 2: Hepatitt C AND ((Seksuelt overførbare sykdommer OR (Sex AND Smitte))

Fordi vi finner alle artiklene i PICO 1 i PICO 2, foreslår jeg å slå sammen PICOene til en søkestrategi. Oppdragsgiver må sortere artiklene til riktig PICO selv.

Ferdig søkestrategi

1
exp Hepatitis C/
59239
2
("Hepatitis C" or "parenterally transmitted non a non b hepatitis" or "parenterallytransmitted non a non b hepatitis" or "parenterally transmitted nona nonb hepatitis" or "parenterallytransmitted nona nonb hepatitis" or "PT NANBH" or PTNANBH).tw,kf.
71482
3
1 or 2
84414
4
Sexually Transmitted Diseases/ or Sexually Transmitted Diseases, Viral/
24641
5
((sexual* adj2 (transmission or transmitted)) or ((venereal or veneral) adj (disease? or infection?))).kw,kf.
5851
6
4 or 5
26614
7
3 and 6
637
8
Coitus/ or Unsafe Sex/
11232
9
(intercourse? or copulation? or "sexual acts" or "penetrative sex" or Coitus or coition? or "sexual union?" or "Unsafe Sex" or "High Risk sex*" or "highrisk Sex*" or "Unprotected Sex" or barebacking or "bareback sex" or fisting or "fist fucking" or handballing).tw,kf.
28842
10
8 or 9
34756
11
Disease Transmission, Infectious/
8069
12
((disease or virus or viral or Pathogen or Infection or Autochthonous or Infectious) adj2 (Transmission? or transfer*)).kw,kf.
875
13
11 or 12
8886
14
3 and 10 and 13
16
15
7 or 14
649


Arbeidet med søkeordene til dette søket er nærmere beskrevet i denne artikkelen


Fra PICO til søk III - eksempel med sekkeposter

Av og til registrerer vi sekkeposter i PICO-skjemaet. Det er ofte nødvendig å spesifisere sekkeposter nærmere for å kunne søke på dem. Ønsker man f.eks. et søk på behandling av "ikke-smittsomme sykdommer", kan det hende du får noen relevante treff dersom du søker på "noncommunicable diseases", men det er også nødvendig å søke på de spesifikke sykdommene (diabetes, slag, hjertesykdommer, osv.). "Behandling" er også en sekkepost. Søkeordet "Treatment" vil fange opp mange behandlinger, men neppe alle.

Dersom det ikke er mulig å spesifisere sekkeposter, bør vi sjekke om vi kan ekskludere de fra søket, og sortere ut de relevante artiklene manuelt når vi gjennomgår trefflistene. Er de andre søkekomponentene spesifikke nok til at vi uansett ikke får altfor mange dersom vi begrenser søket til disse? Kjør testsøk for å sjekke!

PICO Fødselsdepresjon er et kjent fenomen, men noen opplever depresjon allerede i svangerskapet. Hvordan kan vi fange opp disse mødrene, og hvilket tilbud bør de motta?


Populasjon: Gravide med depresjon
Intervensjon: Fange de opp, gi dem behandling eller et tilbud
Utfall: Bedre oppfølging, Bedring

Søkekomponentene vi henter ut fra dette søket er kun fra Populasjonen: Gravide AND Depresjon. De to søkekomponentene kobles sammen med operatoren AND.

For hver søkekomponent leter vi frem kontrollerte emneord og søkeord til fritekstsøk. Disse ordene kobler vi sammen med operatoren OR.

Ferdig søkestrategi


1
Pregnancy/ or Pregnancy in Adolescence/ or exp Pregnancy, Multiple/ or Pregnancy, Unplanned/ or Pregnancy, Unwanted/ or Pseudopregnancy/ or exp Pregnancy Trimesters/ or Prenatal Diagnosis/ or Pregnant Women/ or Prenatal Care/ or Perinatal Care/
838183
2
(pregnan* or gestation or pseudopregnan* or pseudocyesis or "early placental phase*" or prenatal* or "pre natal*" or antenatal or "ante natal" or perinatal or "peri natal").tw,kf.
625007
3
1 or 2
1013817
4
Depression/ or Depressive Disorder/ or Depressive Disorder, Major/ or Depressive Disorder, Treatment-Resistant/ or Dysthymic Disorder/
190371
5
(depression* or depressive or melanchol* or "involutional psychos*" or "involutional paraphrenia*" or "dysthymic disorder*" or dysthymia or dysforia or cothymia or "unipolar disorder*" or "mental anorexia" or "mental fatigue").tw,kf.
345435
6
4 or 5
387280
7
3 and 6
15315


Mange treff, sier du? Neste skritt er å fortelle oppdragsgiver at vi bør avgrense til systematiske oversikter!

mandag 22. oktober 2018

Hold orden på søkeordene

Når du samler søkeord på en systematisk måte, er det viktig at du klarer å holde orden på hvilke emneord du finner i hvilke databaser, hvilke emneord du ennå ikke har søkt opp, hvilke ord til fritekstsøket som er innhentet, og hvilke friteksttermer som mangler.


Jeg løser dette på forskjellige måter alt etter hvor omfattende søket er. Jo mer omfattende, jo mer hjelp trenger jeg til å holde oversikt over hvilke oppgaver som er gjort, og hva som gjenstår.


Her presenteres tre ideer for hvordan man kan holde orden på søkeordene underveis i prosessen mot en ferdig søkestrategi. For enkle søk foreslår jeg å samle alle søkeord i Notepad+, men hvis du er nybegynner, kan det være lurt å bruke skjemaet som presenteres under avansert søk, selv om søket ikke er så veldig omfattende. Etter hvert som du blir tryggere, så vil du merke at det skjemaet blir overflødig.


Suppler gjerne med Notepad+, også når du bruker Word for å holde oversikt. Det gjør jeg! En liste med 500 termer til fritekstsøket, er langt enklere å forholde seg til i Notepad+ enn i Word. Ikke minst fordi det ikke er tekstformateringer.


PS: Ved innstallering av Notepad+ er det aktivert autofullfør, som du bør deaktivere ved å gå til Oppsett > Innstillinger > Auto-Compleation


Hold orden på søkeordene i enkle søk
Hold orden på søkeordene i avanserte søk
Hold orden på søkeordene i ekstra avanserte søk

Hold orden på søkeordene i ekstra avanserte søk

Valg av verktøy

På avanserte søk, bruker jeg Word for å holde oversikt over søkeordene. Det blir lettere å holde styr på hva som er gjort, og hva som fremdeles gjenstår.


På skikkelige store søk der det er ekstremt mange emneord å holde styr på, velger jeg et oppsett der jeg har kontroll over hva det samme emneordet heter i de forskjellige databasene. dersom det ikke fins et tilsvarende emneord, markerer jeg feltet med grått. På den måten husker jeg om jeg har sjekket termen.


Ofte skriver jeg med rød skrift i margen hvilke oppgaver som gjenstår før jeg kan si meg ferdig med søkebolken, og gjerne også "Ferdig", når jeg har sjekket alle emneord i alle databasene, og notert alle tekstord.


Ulempen med å bruke Word er først og fremst de automatiske formateringene, særlig at " endres  automatisk til «. Lag kladden i Notepad+ og/eller kopier tegnet " og lim tegnet inn rundt frasene.


Eksempel på en ferdig søkeordsliste

Eksemplet under viser kun et lite utdrag fra søkeordslista over tiltakene i søket "Tiltak for å forebygge fedme hos barn og unge". Her har jeg hentet frem emneord fra fire databaser og sjekket om hver enkelt av dem fins i de andre databasene. Deretter har jeg laget liste over tekstordene jeg fant i Entry Terms og Used for, og andre steder. Tilslutt har jeg effektivisert søkeordene med nærhetsoperatorer og trunkeringstegn.

Forebygging generelt
Medline
Embase
Psycinfo
Eric
Emneord
Ferdig
Primary Prevention/
Prevention/
Primary Prevention/
Prevention/
Prevention/
National Health Programs/
 
 
 
Government Programs/
 
Government Programs/
State Programs/
Federal programs/
National Programs/
Regional Programs/
Health Promotion/
Health Promotion/
Health Promotion/
Health Promotion/
Healthy People Programs/
 
 
Health Programs/
Preventive Health Services/
Preventive Health Service/
 
 
"Early Intervention (Education)"/
early intervention/
Early Intervention/
Early Intervention/
Program Development/
Program Development/
Program Development/
Program Development/
Program Evaluation/
Program Evaluation/
Program Evaluation/
Program Evaluation/
Tekstord
Ferdig
(Prevent* or program* or "health promotion?" or "Early Intervention?").tw.
Environment – bygninger og byplanlegging for tilrettelegging av fysisk aktivitet
Medline
Embase
Psycinfo
Eric
Emneord
Ferdig

City Planning/
Urban Renewal/
city planning/
Urban Planning/
Urban Planning/
Social Planning/
 
Community Development/
Community Development/
Community Planning/
Environment Design/
Environmental Policy/
environmental planning/
Environmental Policy/
Environmental Planning/
Environmental Policy/
Built Environment/
 
Sports and Recreational Facilities/
 
 
Recreational Facilities/
Physical Education Facilities/
Parks, Recreational/
recreational park/
Recreation Areas/
Parks/
Swimming Pools/
swimming pool/
 
 
Architecture/
architecture/
Architecture/
Architecture/
Building Design/
Facility Guidelines/
Facility Requirements/
Educational/ Facilities Design/
 
public open space/
 
 
 
 
Community Facilities/
 

Tekstord
Ferdig
 
("green area?" or "green space?" or (environment* adj1 (policy or policies or planning? or design* or physical or built)) or ((city or town or urban or community or rural) adj1 (planning? or renewal? or development? or architecture or design*)) or ((community or national or recreational or urban) adj1 park?) or "public open space").tw.
 
(((Sport? or Recreational) adj1 (arena? or facilit* or club?)) or (swimming adj1 pool?) or ((Bicycle or Bicycling or walking or cycle or cycling) adj (path? or trail? or infrastructure or facilit*)) or walkability or bikeability or "walk ability" or "bike ability").tw.
 
("Social Planning?" or "Development Plan?" or "Built Environment?" or "healthy place?" or ((Educational or public) adj1 (Facilit* or Building*) adj1 (Guideline* or Requirement* or design*))).tw.

Hold orden på søkeordene i avanserte søk

Valg av verktøy

På avanserte søk, bruker jeg Word for å holde oversikt over søkeordene. Det blir lettere å holde styr på hva som er gjort, og hva som fremdeles gjenstår. Ofte skriver jeg med rød skrift i margen hvilke oppgaver som gjenstår før jeg kan si meg ferdig med søkebolken, og gjerne også "Ferdig", når jeg har sjekket alle emneord i alle databasene, og notert alle tekstord.


Hvis det ikke fins emneord i en database, noterer jeg en -
slik at jeg husker at jeg er ferdig med oppgaven


Ulempen med å bruke Word er først og fremst de automatiske formateringene, særlig at " endres  automatisk til «. Lag kladd i Notepad+ og/eller kopier tegnet " og lim tegnet inn rundt frasene.


Eksempel på en ferdig søkeordsliste

Eksemplet viser søkeord for populasjonen i søket "Tiltak for å forebygge fedme hos barn og unge". Her har jeg hentet frem emneord fra fire databaser og sjekket om hver enkelt av dem fins i de andre databasene (at det står i rødt at det gjenstår å sjekke emneordene for Eric, er kun for å illustrere). Deretter har jeg laget liste over tekstordene jeg fant i Entry Terms og Used for, og andre steder. Tilslutt har jeg effektivisert søkeordene med nærhetsoperatorer og trunkeringstegn.


Unge 10-19 år
Medline Pediatrics/ or Child/ or Adolescent/ or Young Adult/
Embase pediatrics/ or juvenile/ or child/ or boy/ or girl/ or school child/ or adolescent/ or Young Adult/ or adolescence/ or childhood/
Psycinfo pediatrics/ or Elementary School Students/ or Intermediate School Students/ or Middle School Students/ or Junior High School Students/ or High School Students/ or College Students/
Eric
Sjekk disse emneordene i de andre basene
(MH "Pediatrics") OR (MH "Adolescents") OR (MH "Children") OR (MH "Preadolescents") OR (MH "Early Adolescents") OR (MH "Late Adolescents") OR (MH "Young Adult") OR (MH "Junior High School Students") OR (MH "High School Students") OR (MH "Secondary School Students") OR (MH "Elementary School Students") OR (MH "Middle School Students") OR (MH "College Students")
Tekstord (child* or adolescen* or preadolescent* or pediatric* or paediatric* or boy? or girl? or kid? or juvenil* or under?age* or teenager* or teen? or minor* or pubescen* or young people or young person* or youth? or youngster* or young adult? or young women or young woman or young man or young men).tw.
Kommentar Aldersgrupper i mesh: Child= 6-12 år, Adolescent=13-18 år, Young adult=19-24 år
Overvekt og fedme - Ferdig
Medline Overweight/ or Obesity/ or obesity, abdominal/ or obesity, morbid/ or Adiposity/ or body weight changes/ or weight gain/
Embase obesity/ or abdominal obesity/ or morbid obesity/ or body weight change/ or weight gain/
Psycinfo Overweight/ or Obesity/ or weight gain/
Eric (MH "Obesity")
Tekstord (obesity or Obesities or obese or obesitas or adipos* or "fat overload").tw.
(overweight or "over weight" or (weight adj1 (change* or gain*)) or (Excess* adj2 (fat or weight))).tw
Kombinasjoner som må søkes separat - Ferdig
Medline pediatric obesity/
Overweight/pc or Obesity/pc or obesity, abdominal/pc or obesity, morbid/pc or Adiposity/pc or body weight changes/pc or weight gain/pc or pediatric obesity/pc (PC=prevention and control)
Embase adolescent obesity/ or childhood obesity/
Psycinfo -
Eric -

fredag 19. oktober 2018

Hold orden på søkeordene i enkle søk

Valg av verktøy

Her bruker jeg Notepad+. Den er bare egnet dersom det ikke er altfor mange emneord og søkekomponenter å holde orden på. Dersom det blir vanskelig, må du bruke en annen fremgangsmåte. Fordeler med denne enkle metoden:
  • Du har kontroll på parenteser. Når du setter markøren ved en parentes, ser du hvilken den hører sammen med.



  • Du trenger ikke lagre dokumentet.
  • Du kan se om jeg har brukt samme søkeord flere ganger - når du merker det, merkes alle andre forekomster av ordet. Da ser du lettere hvilke linjer som kan slås sammen med nærhetsoperator.
  • Ingen formateringer.
  • Det er lettere å oppdage ekstra mellomrom og andre feil i strategien.
  • Profilen er klar for maskinell oversetting til andre databaser.

Søkeprofil in the making...

Her har jeg hentet frem MeSH-termer og Emtree-termer og laget liste over tekstord. Disse fant jeg listet opp i Entry Terms og Used for. Jeg har underveis satt på noen trunkeringstegn istedet for å kopiere inn flertallsformen. Og fordi jeg allerede har "Intercourse" på søkeordlista, har jeg ikke tatt med f.eks. "Sexual intercourse". Nå gjenstår det å effektivisere fritekstsøket, før søkeprofilen er klar.


Hepatitt C
MeSH: exp Hepatitis C/
Embase: exp Hepatitis C/
tekstord:
Hepatitis C
parenterally transmitted non a non b hepatitis
parenterally-transmitted non-a non-b hepatitis
PT-NANBH

Overføring seksuelt
MeSH: Sexually Transmitted Diseases/ or Sexually Transmitted Diseases, Viral/
Embase: sexually transmitted disease/ or sexual transmission/
tekstord:

sexual transmission
sexual transmitted Disease?
Sexually Transmitted Infection?
sexual disease transmission
venereal disease?
veneral disease?
venereal Infection

Samleie (vaginalt, analt, usikker sex)
MeSH: Coitus/ or Unsafe Sex/
Embase: sexual intercourse/ or exp penetrative sex/ or exp unsafe sex/
tekstord:

intercourse
sexual act
penetrative sex
Coitus
coition
sexual union
Unsafe Sex
High Risk Sex
high-risk sexual behavior
high-risk sexual behaviour
Unprotected Sex
barebacking
bareback sex
fisting
fist fucking
handballing


Smitte
MeSH: Disease Transmission, Infectious/
Embase: disease transmission/ or virus transmission/
tekstord: disease transmission
virus transmission
viral transmission
Pathogen Transmission
Infection Transmission
Autochthonous Transmission
Horizontal Infection Transmission
Horizontal Transmission of Infectious Disease
infection transfer
infection transmission
infectious transmission
transmission of infection


Ferdig profil

Hepatitt C
MeSH: exp Hepatitis C/
Embase: exp Hepatitis C/
tekstord: ("Hepatitis C" or "parenterally transmitted non a non b hepatitis" or "parenterallytransmitted non a non b hepatitis" or "parenterally transmitted nona nonb hepatitis" or "parenterallytransmitted nona nonb hepatitis" or "PT NANBH" or PTNANBH)

Overføring seksuelt
MeSH: Sexually Transmitted Diseases/ or Sexually Transmitted Diseases, Viral/
Embase: sexually transmitted disease/ or sexual transmission/
tekstord: ((sexual* adj2 (transmission or transmitted)) or (venereal or veneral) adj (disease? or infection?))

Samleie (vaginalt, analt, usikker sex)
MeSH: Coitus/ or Unsafe Sex/
Embase: sexual intercourse/ or exp penetrative sex/ or exp unsafe sex/
tekstord: (intercourse? or copulation? or "sexual acts" or "penetrative sex" or Coitus or coition? or "sexual union?" or "Unsafe Sex" or "High Risk sex*" or "highrisk Sex*" or "Unprotected Sex" or barebacking or "bareback sex" or fisting or "fist fucking" or handballing)

Smitte
MeSH: Disease Transmission, Infectious/
Embase: disease transmission/ or virus transmission/
tekstord: ((disease or virus or viral or Pathogen or Infection or Autochthonous or Infectious) adj2 (Transmission? or transfer*))